光动力疗法治疗尖锐湿疣具有一定安全性，但也存在个体差异等情况需要综合考量。
局部皮肤反应方面的安全性
治疗后局部可能出现轻度红斑、肿胀等反应，一般较为轻微，多可自行缓解，这是因为光动力作用于病变组织及周围皮肤导致的局部炎症反应，多数患者可耐受。
全身不良反应情况
全身不良反应相对较少见，部分患者可能出现低热等情况，通常程度较轻，是机体对治疗的一种应激反应，一般无需特殊处理可自行恢复。
对特殊人群的安全性考量
对于孕妇、儿童等特殊人群，需谨慎评估。孕妇使用光动力疗法要权衡利弊，因为孕期特殊生理状态可能影响治疗安全性及对胎儿的潜在影响；儿童由于皮肤等组织发育未成熟，使用光动力疗法需严格掌握适应证，充分评估风险后谨慎实施。
与其他治疗方式对比的安全性特点
相较于一些传统治疗方式，光动力疗法在精准破坏病变组织的同时，对周围正常组织损伤相对较小，从一定程度上体现了其在安全性方面的优势，但具体还需根据患者的具体病情来综合判断选择合适的治疗方案。