核磁共振不能对全身进行全面检查，它是通过磁场和射频脉冲来获取人体内部组织的图像信息，但其检查范围受限于身体部位对磁场和射频的耐受性等因素。
一、头部部位检查
头部是常见的核磁共振检查部位，可清晰显示脑部的结构，如大脑皮层、脑室系统等，对于诊断脑部肿瘤、脑梗死、脑出血等疾病有重要价值，尤其适用于怀疑有脑部病变但其他检查不够清晰的情况。
二、脊柱部位检查
脊柱的核磁共振检查能很好地呈现脊髓、椎间盘、椎体等结构，有助于诊断椎间盘突出、脊髓损伤、椎管内肿瘤等脊柱相关疾病，对判断脊柱病变对神经的压迫情况等有重要意义。
三、胸部部位检查
胸部核磁共振可用于观察心脏、大血管以及肺部等结构，对心肌病、心包疾病、肺部肿瘤等的诊断有一定帮助，但对于肺部气体较多的情况，有时不如胸部CT清晰。
四、腹部部位检查
腹部核磁共振能对肝脏、胆囊、胰腺、脾脏、肾脏等器官进行检查，可用于诊断肝脏肿瘤、胰腺囊肿、肾脏结石等疾病，不过对于胃肠道等含气器官的显示相对有限。
特殊人群方面，装有心脏起搏器等金属植入物的患者通常不能进行核磁共振检查，因为磁场可能会影响植入物的功能；孕妇在进行核磁共振检查时需谨慎评估，一般只有在必要且无其他替代检查的情况下才会考虑，要充分权衡利弊，确保对胎儿无不良影响。