一、呕吐
1.频繁性：新生儿肠道畸形较常见的症状是呕吐，且往往较为频繁。例如先天性十二指肠闭锁的患儿，生后数小时即可出现呕吐，呕吐物多为奶汁、胆汁等。这是因为肠道畸形导致肠道不通畅，食物无法顺利通过，从而引起反流性呕吐。
2.呕吐物特点：不同类型的肠道畸形呕吐物有所差异。如先天性幽门肥厚性狭窄，呕吐多在生后2-4周出现，为进行性加重的呕吐，呕吐物为带凝块的奶汁，不含胆汁。而先天性肠旋转不良发生肠梗阻时，呕吐物可含有胆汁，严重时呈棕绿色，似粪便样。
二、腹胀
1.腹胀表现：肠道畸形可导致腹胀。比如先天性巨结肠，患儿出生后多有胎便排出延迟的情况，随后出现进行性腹胀，腹部膨隆如鼓。这是由于病变肠段痉挛，近端肠管扩张，积气积液所致。
2.腹胀程度与范围：腹胀程度因畸形类型而异。某些肠道闭锁的患儿，腹胀可较为明显，全腹膨隆；而一些较轻的肠道畸形引起的腹胀可能相对局限，但也会随着病情发展而加重。
三、排便异常
1.胎便排出异常
-胎便排出延迟：许多肠道畸形患儿存在胎便排出延迟的情况。例如先天性巨结肠，正常新生儿生后24小时内应该排出胎便，而先天性巨结肠患儿往往超过48小时仍未排出胎便。这是因为病变肠段神经节细胞缺如，肠管痉挛，胎便通过受阻。
-胎便性状异常：部分肠道畸形患儿胎便性状也有改变。如胎粪性肠梗阻，由于胎儿时期肠道内缺乏某些酶或其他原因，导致胎便粘稠，呈胶冻样，难以排出。
2.正常排便后再次出现排便异常：在正常排便一段时间后，肠道畸形引起肠梗阻的患儿会再次出现不排便的情况。例如肠套叠的新生儿，可能先有正常排便，然后出现果酱样大便，随后停止排便，同时伴有阵发性哭闹等症状。
四、腹部包块
1.包块特点：某些肠道畸形可触及腹部包块。如先天性肠套叠，在右上腹可触及腊肠样包块。这是因为套叠的肠管形成肿块。而先天性肾母细胞瘤虽然不属于肠道畸形，但有时需要与肠道畸形相鉴别，不过肠道畸形中的某些类型如肠重复畸形也可能在腹部触及包块，其包块边界清楚，活动度可能因畸形位置而异。
2.包块伴随症状：触及腹部包块时往往伴有其他症状，如肠套叠时除了腹部包块外，还有呕吐、哭闹不安等表现；肠重复畸形若合并感染等情况，可能出现发热等症状。
五、全身情况
1.精神状态：由于肠道畸形导致的不适，新生儿全身情况会受到影响。如果肠道畸形引起严重的肠梗阻，患儿会出现精神萎靡、反应差等情况。因为长时间的呕吐、腹胀等会导致新生儿体内电解质紊乱、营养物质摄入不足，从而影响全身的代谢和功能，表现为精神状态不佳。
2.营养状况：长期的肠道畸形会影响新生儿的营养吸收。例如肠道闭锁的患儿，不能正常进食通过肠道吸收营养，会出现体重不增甚至下降的情况，同时可能伴有贫血等营养缺乏的表现。